Paleogenomic investigation of the Evolution of European populations using computational simulations

Notre projet va contribuer à l'étude de la préhistoire humaine, en se concentrant plus particulièrement sur les conséquences évolutives de la succession de migrations et de mélanges entre populations sur le continent européen, au cours du temps.

Nous allons exploiter pleinement les développements méthodologiques réalisés lors de nos précédents projets, afin de simuler conjointement des données génomiques contemporaines et anciennes sous des modèles évolutifs complexes. Notre approche originale et interdisciplinaire de modélisation et de simulations informatiques vise à maximiser l'information qui peut être tirée des données paléogénomiques sur la démographie et les migrations passées des humains en Eurasie occidentale.

En effet, la simulation numérique permet de tester des hypothèses complexes avec des modèles qui combinent, notamment, les mouvements des populations (migration), leurs interactions (mélanges, compétition), leurs variations démographiques, ainsi que les effets potentiels de la sélection naturelle.

Nous allons tout d’abord représenter les principales hypothèses évolutives sous forme de modèles mathématiques et de paramètres. Puis, nous simulerons ces modèles à l’aide de programmes informatiques développés dans notre groupe de recherche. Finalement, nous évaluerons la vraisemblance des hypothèses associées à chaque modèle en confrontant les résultats des simulations à des données moléculaires réelles grâce à des méthodes d’estimation bayésienne.

Contexte scientifique et social du projet de recherche

Outre une meilleure compréhension du fascinant sujet de la préhistoire européenne, notre projet permettra de mieux déchiffrer des mécanismes biologiques complexes. Les développements méthodologiques pourront être utiles dans d’autres contextes de recherche en biologie évolutive, avec des applications potentielles en génétique de la conservation ou en lien avec des recherches biomédicales.